二院目前有二部、网络信息部、23所、25所、203所、206所、207所、706所、航天长峰共9个单位招收和培养硕士研究生，全部地处北京市区。二院同时还负责中国航天科工集团四院四部、四院17所、四院8511所、四院航天晨信研究生的招生和培养工作。